Stopnja absorpcije magnezija v prebavilih je odvisna od trenutnega stanja preskrbljenosti v telesu. Ko telo potrebuje več magnezija, se ga absorbira več; presežek, ki ga telo ne potrebuje, ostane v črevesju in se izloči z blatom. Zaradi osmotskega učinka lahko previsok odmerek povzroči mehkejše blato ali drisko. V tem primeru priporočamo zmanjšanje odmerka ali bolj enakomerno razporeditev čez dan.

Optimalni odmerek je običajno tik pod pragom, ko se pojavijo prebavne težave. Večina ljudi dobro prenaša približno 200 mg dnevno. Od tam lahko odmerek postopoma zvišujete. Pomemben je tudi čas jemanja – bolje je zaužiti manjše odmerke 2–3-krat dnevno kot celoten odmerek naenkrat.

Tudi vrsta magnezija vpliva na toleranco. Organske oblike so večinoma prijaznejše za prebavo kot anorganske. Več informacij najdete v našem prispevku o magneziju.