Stopnja absorpcije magnezija v črevesju je odvisna od trenutnih potreb telesa. Ko ga potrebujemo več, se tudi več absorbira. Odvečen magnezij ostane v črevesju in se izloči z blatom — zaradi osmotskega učinka lahko povzroči mehkejše ali celo tekoče blato. Če se to zgodi, priporočamo, da odmerek zmanjšaš ali ga še bolj razporediš čez dan.
Območje tik pod „mejo za drisko“, kjer nimaš prebavnih težav, je običajno tvoja optimalna osebna doza. Najpogosteje je dobro prenašano okoli 200 mg. Od tam lahko počasi povečuješ odmerek.
Tudi oblika magnezija je pomembna — organske oblike so bistveno prijaznejše do prebave kot anorganske.